Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms