Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smarcal1Q8BJL0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smarcal1Q8BJL0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smarcal1Q8BJL0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smarcal1Q8BJL0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smarcal1Q8BJL0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Smarcal1Q8BJL0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smarcal1Q8BJL0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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