Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms