Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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