Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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