Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms