Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg9bQ6EBV9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg9bQ6EBV9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg9bQ6EBV9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg9bQ6EBV9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9bQ6EBV9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms