Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms