Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SnrpcQ62241 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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SnrpcQ62241 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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