Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phox2aQ62066 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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