Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AcanQ61282 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms