Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms