Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms