Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf3Q60765 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms