Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk2a1Q60737 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms