Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm28915-201ENSMUST00000189145 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm36990-201ENSMUST00000191961 1412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Repin1Q5U4E2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms