Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms