Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms