Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms