Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Znf48Q3US17 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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