Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms