Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms