Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms