Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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