Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tbc1d2bQ3U0J8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tbc1d2bQ3U0J8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbc1d2bQ3U0J8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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