Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms