Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc162pQ0VG85 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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