Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms