Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnnm1Q0GA42 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms