Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms