Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RykQ01887 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms