Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms