Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms