Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabpaQ00422 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms