Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms