Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme1P97371 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme1P97371 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms