Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tubg1P83887 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tubg1P83887 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tubg1P83887 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tubg1P83887 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms