Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chl1P70232 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms