Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Traf5P70191 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Traf5P70191 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf5P70191 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf5P70191 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf5P70191 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf5P70191 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf5P70191 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf5P70191 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms