Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ctdsp1P58466 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ctdsp1P58466 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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