Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp25P57080 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms