Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp5P56399 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp5P56399 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms