Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc3P49135 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms