Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms