Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VdrP48281 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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VdrP48281 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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VdrP48281 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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VdrP48281 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VdrP48281 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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