Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms