Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxraP28700 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RxraP28700 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RxraP28700 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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