Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb9P28076 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb9P28076 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms