Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgaP26339 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms