Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms